Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC138Q96M89 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC138Q96M89 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms