Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAMD8Q96LT4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms