Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00208Q96KT6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms