Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CELF6Q96J87 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms