Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
BCANQ96GW7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCANQ96GW7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms