Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEIL1Q96FI4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms