Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SGF29Q96ES7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SGF29Q96ES7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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