Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4CQ96DT6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4CQ96DT6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms