Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms