Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC1Q96C34 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms