Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VTI1AQ96AJ9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VTI1AQ96AJ9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms