Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RFT1Q96AA3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms