Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC47Q96A33 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC47Q96A33 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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