Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L4Q8WXT5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L4Q8WXT5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L4Q8WXT5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L4Q8WXT5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L4Q8WXT5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L4Q8WXT5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L4Q8WXT5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L4Q8WXT5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L4Q8WXT5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L4Q8WXT5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L4Q8WXT5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L4Q8WXT5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L4Q8WXT5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L4Q8WXT5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L4Q8WXT5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L4Q8WXT5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L4Q8WXT5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L4Q8WXT5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms