Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATRIPQ8WXE1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATRIPQ8WXE1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms