Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSMEM1Q8WWF3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms