Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC12Q8WUD4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC12Q8WUD4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms