Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATL2Q8NHH9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms