Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELBQ8NG08 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELBQ8NG08 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms