Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYRIPQ8NFW9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYRIPQ8NFW9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms