Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC148Q8NFR7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms