Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TMIEQ8NEW7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIEQ8NEW7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms