Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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