Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USP38Q8NB14 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
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