Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMER3Q8N944 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMER3Q8N944 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms