Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRACR2BQ8N4Y2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms