Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SVOPQ8N4V2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVOPQ8N4V2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms