Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHCHD4Q8N4Q1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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