Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG2Q8N3U4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms