Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms