Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDKL3Q8IVW4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL3Q8IVW4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms