Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNL1Q8IU54 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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