Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX7Q7RTT5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms