Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RUFY3Q7L099 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUFY3Q7L099 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms