Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PREX2Q70Z35 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PREX2Q70Z35 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PREX2Q70Z35 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PREX2Q70Z35 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms