Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BBS12Q6ZW61 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BBS12Q6ZW61 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms