Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP47Q6ZTR5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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