Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBC1D9Q6ZT07 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBC1D9Q6ZT07 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms