Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAPN12Q6ZSI9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAPN12Q6ZSI9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms