Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00299Q6ZSB3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00299Q6ZSB3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms