Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms