Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFXL1Q6ZNB6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFXL1Q6ZNB6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms