Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms