Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LRIG3Q6UXM1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LRIG3Q6UXM1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms