Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SUSD1Q6UWL2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms