Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAF7Q6Q0C0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms