Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTC41PQ6P2S7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms