Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC27A4Q6P1M0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC27A4Q6P1M0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms