Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RWDD4Q6NW29 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RWDD4Q6NW29 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms