Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCTP1Q6DN14 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms